Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms