Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB3PQ58FF7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB3PQ58FF7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms