Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRD12Q587J7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms