Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf17Q53FE4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms