Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN2Q504Q3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAN2Q504Q3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms