Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC153Q494R4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms