Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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