Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTC4SQ16873 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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