Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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SNAPC1Q16533 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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SNAPC1Q16533 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SNAPC1Q16533 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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