Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK4Q16099 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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