Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELOBQ15370 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms