Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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