Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRS1Q15050 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRS1Q15050 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms