Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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