Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNGB1Q14028 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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