Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms