Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
KCNC3Q14003 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNC3Q14003 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms