Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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