Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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