Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRQ13535 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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