Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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