Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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