Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3B2Q13367 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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