Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3FQ13275 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms