Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SRSF5Q13243 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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