Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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