Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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NR1H3Q13133 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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NR1H3Q13133 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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NR1H3Q13133 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR1H3Q13133 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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