Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RESTQ13127 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RESTQ13127 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RESTQ13127 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RESTQ13127 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RESTQ13127 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RESTQ13127 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RESTQ13127 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RESTQ13127 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RESTQ13127 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RESTQ13127 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RESTQ13127 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms