Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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