Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRDM2Q13029 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
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