Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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