Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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GTF3C1Q12789 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GTF3C1Q12789 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GTF3C1Q12789 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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GTF3C1Q12789 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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