Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms