Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GOLGA3Q08378 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA3Q08378 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms