Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGM3Q08188 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms