Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms