Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms