Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN1Q05586 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN1Q05586 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms