Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARDQ03181 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms