Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREMQ03060 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREMQ03060 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREMQ03060 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREMQ03060 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREMQ03060 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREMQ03060 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREMQ03060 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREMQ03060 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREMQ03060 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREMQ03060 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREMQ03060 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CREMQ03060 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREMQ03060 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms