Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF8Q02556 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms