Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC10Q01780 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC10Q01780 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms