Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms