Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF9Q00978 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms