Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC5Q00444 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC5Q00444 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms