Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG2P63267 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTG2P63267 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms