Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTG1P63261 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms