Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTA2P62736 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTA2P62736 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms