Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPEP62304 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms