Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RND3P61587 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RND3P61587 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RND3P61587 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RND3P61587 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms